L’église fut construite en 1532.
Lors de la première guerre mondiale, Louis Piret, un industriel belge, transféra son activité sidérurgique à Bonnières,
L'église Saint-Ouen de Bennecourt devint ainsi la paroisse des nombreux ouvriers belges qui arrivèrent à cette occasion.
En 1920, Louis Piret offrit des vitraux pour le transept de l’église, dans le but d’exprimer la paix retrouvée et la victoire de 1918. Le déambulatoire comporte des portraits du roi Albert 1er, de la reine Elisabeth et du Prince Léopold.