La proximité avec le Mont-Saint-Michel, à vingt-sept kilomètres, a entraîné le développement d’une intense vie religieuse. L’église de Bazouges-la-Pérouse est un des édifices les plus imposants de la région et son histoire est singulière.
Jouxtant le mur nord d’un petit monastère fondé au VIIe siècle, une église paroissiale est fondée par les moines de l’abbaye de Marmoutiers. Ainsi les moines célèbrent leurs offices dans la « haute église » au sud, tandis que « l’église basse » au nord est réservée au culte paroissial.
Au XIIe siècle, les moines de l’abbaye de Rillé de Fougères réunissent les deux édifices préromans en une seule et vaste église. Ils ne sont distincts que de quelques marches et par des grilles en fer forgé. Au XIXe siècle, l’édifice est profondément remanié. Un seul chevet est conservé et l’église passe de six à trois vaisseaux : une nef centrale et deux bas-cotés. Étonnamment et conformément aux plans d’Anger de La Loriais, l’église est désorientée : le chevet étant situé à l’ouest, alors que traditionnellement les édifices chrétiens sont orientés vers l’est, en direction du soleil levant.
Pour la construction de cette nouvelle église, de nombreux éléments anciens sont réutilisés et un second clocher surmonté d’une flèche de granit est ajouté en 1885 par Arthur Regnault, architecte rennais reconnu.