Succédant à un premier édifice du 7e siècle, lui-même reconstruit au 12e siècle puis en 1304 et détruit au cours de la Première Guerre mondiale, l’église de Warneton a été érigée en 1924 sur les plans de l’architecte Raison. Moderne, l’édifice allie les styles néoroman et néobyzantin. Construit en briques claires, le sanctuaire est imposant et possède une nef immense bordée de collatéraux et est caractérisé par sa haute tour présente en façade. Il abrite en outre deux caveaux exceptionnels provenant de l’édifice précédent. Découverts en 1924 sous le chœur de l’ancienne église, ces sépultures ont été transportées dans une crypte aménagée sous la nouvelle tour. Datant du 14e siècle, ils sont ornés de peintures polychromes. Le premier est décoré d’un calvaire, de saints entourés d’un blason et d’un Abraham en trône. Le second est orné d’une série de blasons parmi lesquels celui de Robert de Cassel, fils du comte de Flandre Robert III, et qui fut enterré à Warneton après sa mort en 1331. Parmi le mobilier ancien conservé dans l’église se trouvent de belles stalles baroques réalisées en 1714, seul vestige d’une ancienne abbaye. Le reste du mobilier, dont l’autel entièrement recouvert de céramiques, est contemporain. Les vitraux évoquent la vie du Christ, les patrons de l’église et Jean de Warneton, évêque de Thérouanne.
Classement comme monument le 22 octobre 1973