Le nom du passage fait référence au musée du Prado en Espagne, avant cette date, il est appelé "passage du Bois-de-Boulogne". Le passage est créé en 1785. Initialement découvert, il est couvert en 1925. Des travaux de rénovation ont eu lieu en 2012. La mise en lumière est assurée par l'artiste Yann Kersalé.