Les pompes de cale sont utilisées pour écoper l’eau se filtrant à l’intérieur du navire.
Elles sont très importantes à bord d’un bateau en bois où les filtrations d’eau sont habituelles malgré le traitement isolant de la coque et du pont.
On ne connaît pas exactement le nombre et la disposition des pompes de cale originales de la Carmen Flores, mais on sait qu’elles étaient situées dans la partie centrale du bateau et aspiraient l’eau accumulée au travers de tubes en bronze.
Pour des questions de sécurité et de commodité, la réglementation oblige le bateau à être équipé de pompes de cales modernes, mais la Santa Eulàlia a conservé ses pompes traditionnelles en parfait état de marche.