D'après la légende, lors du transfert du corps de Saint Malo, les Alethiens (habitants du quartier d'Aleth à Saint-Malo) s'arrêtèrent à Guipry au village du Pont Neuf et reçurent l'hospitalité chez un châtelain paralysé qui mit à leur disposition, un bâtiment complet de sa propriété. Là, ils dressèrent un autel et déposèrent les reliques du Saint. Le lendemain, le paralytique fut guéri et en reconnaissance, il donna son patrimoine. Ce lieu qui s'appelait « Fili » fut l'origine du nom de la commune « Saint-Malo-de-Phily » et qui veut dire « Heureux ou bien-aimé ». Les fresques de l'église, oeuvres du peintre Emile Bernard racontent ce passage de l'histoire de la commune.