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L'origine du château remonte au XIIIème siècle, époque où il appartenait à la famille Rulant de Fontaine, anciens comtes de Hozémont. Château-fort ancré dans le rocher, il résista à divers assauts avant d'être brûlé par les Hutois à la fin du XIVème siècle. C'est à cette époque que Jean Surlet devient seigneur de Chokier. En 1815, le château devient la propriété de Louis Henri Loison qui y reçoit Napoléon ; mort l'année suivante, Loison est inhumé dans un mausolée créé par Jean-Jacques Flatters dans le parc du château. À la vente du château en 1867, le mausolée contenant ses restes est transféré au cimetière du Père-Lachaise.
Au début des années 2000, le château est acquis par la famille Florani. Le 27 mars 2017, un violent incendie d'origine accidentelle ravage l'aile gauche du château.