L'église actuelle est édifiée en 1877 et remplace une église primitive datant du 13e siècle. En plus d'être construite sur le site de la première église, elle porte le même nom, Notre-Dame de l'Assomption.
Au Moyen-âge, l'église est desservie par le prieur-curé d'Evrunes nommé par l'abbé de Saint-Michel en l'Herm. En 1317, elle est rattachée à l'abbaye de Maillezais puis à l'évêché de la Rochelle en 1669.
Pendant la guerre de Vendée, l'église est détruite à plusieurs reprises.
En 1876, la décision de raser l'édifice roman et de construire une nouvelle église est prise. Pendant près d'un an, les paroissiens d'Evrunes participent à la construction de leur église en transportant les matériaux de construction : sable de la Sèvre, pierres à chaux et pierres de taille, bois pour la charpente...