La gare de Niort est mise en service en 1856 par la Compagnie du chemin de fer de Paris à Orléans (PO), lorsqu'elle ouvre à l'exploitation la section de Saint-Benoît à Niort. La section suivante de Niort à La Rochelle est ouverte en 1857 ce qu'attendait la compagnie pour effectuer l'inauguration de la totalité de sa ligne Poitiers – La Rochelle – Rochefort. Dans les années 1880, l'Administration des chemins de fer de l'État procède à plusieurs ouvertures de plusieurs lignes à voie unique. Ces ouvertures de lignes desservant directement la gare sont complétées par d'autres ouvertures plus lointaines mais permettant des relations avec des villes importantes comme Poitiers, La Rochelle, Bordeaux, Nantes. Cela fait de Niort une importante gare du réseau de l'État avec quotidiennement une moyenne de soixante-dix départs de trains (voyageurs ou marchandises) au début des années 1890.